Shopifyから受注連携された出荷予定をロジクラで編集した場合でも出荷確定連携はされますが、
ロジクラで行った編集の内容はShopifyの注文には反映されません!
注文内容に変更があった場合はShopifyの注文を更新していただくか、
ロジクラの出荷内容がShopifyに反映しないことを了承した上で操作を行ってください。
Q. Shopifyで注文情報を更新しました。ロジクラの出荷予定は更新されますか?
Shopifyで注文を更新したときにロジクラの出荷予定も上書き更新する方法

ロジクラで出荷確定したときに送るデータは「フルフィルメント処理」+「配送会社」+「追跡番号」の3つのみとなります。