ある選択肢を選んだユーザーが、それ以降のシナリオへ進めないようにすることは可能でしょうか？

はい、可能です。メッセージのカラム内にある「このメッセージ以降のシナリオを表示しない」にチェックを入れることで、そのメッセージ以降のシナリオに進めなくなります。